Mobiilipuku Gundam Thunderbolt Mangan tarina on asetettu samaan yhden vuoden sotaan UC 0079: ssä ensimmäisenä mobiilipuku Gundam Anime-sarjana. Se alkaa taisteluilla kahden Zeonin ruhtinaskunnan ja”Thunderbolt-sektorin”ruhtinaskunnan ruhtinaskunnan välissä. Manga englanniksi ja julkaisi 24. volyymin 16. syyskuuta. 2018 Tenosynoviitti (jänteitä ympäröivä tulehdus) johtuen ja jatkoi mangaa joulukuussa 2018. Mangan jatkamisen seurauksena Ohtagaki totesi pahenevien oireiden takia, että hän ei ole pystynyt piirtämään pieniä yksityiskohtia hallitsevan vasemman kätensä käyttämällä, ja mangan laatutasolla. Hän lisäsi, että hän vaihtoi piirustustyyliään, jotta ei pahentanut vasemman kätensä tilaa.
Manga juhli 10-vuotisjuhliaan vuonna 2022. Osana 10. vuosipäivää mangassa oli näyttely Gundamin tukikohdassa Tokiossa syyskuuhun lokakuuhun. Ohtagaki paljasti näyttelyn avaustapahtumassa, että hän aikoi jatkaa mangaa vielä viidestä kuuteen vuoteen.
Manga inspiroi kahta alkuperäistä Net Anime-sarjaa, joista kukin sai kokoamiselokuvan. Ohtagaki piirtää myös mobiilipuku Gundam Thunderbolt Gaiden Spinoff Manga.